Plateforme de Microscopie et Imagerie Scientifique

La plateforme de Microscopie et Imagerie Scientifique s’organise essentiellement autour des techniques de Microscopie photonique : microscopie champ large, confocale et à lumière structurée…

Elle offre un ensemble cohérent de matériels qui permet de travailler par différentes méthodes d’exploration : soit sur cellules ou fragments de tissus fixés sur échantillons fluorescent ou colorés, soit sur des échantillons étudiés de manière dynamique, que ce soit via des techniques de fluorescence ou de contraste de phase. Cette plateforme est partagée par toutes les équipes du CRCM. Elle offre des prestations de formation, de conseils, d’aide à l’interprétation, de mise au point, de traitement et d’analyse d’image, de veille technologique, de gestion et d’organisation.

La plateforme est animé et coordonnée par un ingénieur de recherche (Dr) et comprend les équipements suivants :  

  • Un microscope confocal LSM 510 META (Zeiss).
  • Un microscope à fluorescence à lumière structurée type Apotome (Zeiss) équipé d’une caméra couleur pour échantillons colorés.
  • Deux microscopes à fluorescence équipé pour le time-lapse (Zeiss-Roper Scientifics).
  • Un microscope confocal multi-point équipé d’un « spinning disk », d’un système de FRAP, FLIP, photo-activation, ainsi qu’une capacité de travail en mode TIRF.

    Des stations informatiques de traitement et d’analyse d’images, équipées des logiciels :   

    • Métamorph
    • Huygens (déconvolution 3, 4 et 5D) en réseau installé sur cluster de calcul.
    • Imaris  (Reconstruction et analyse d’images 3, 4 et 5D)
    • ImageJ (traitement et analyse d’images)
    • Logiciel MATLAB en réseau installé sur cluster.

    La plateforme est en perpétuelle évolution pour essayer de s’adapter au mieux à la réalité des projets et aux besoins des utilisateurs.

     

    Responsable et correspondant scientifique : Dr Ali Badache
    Responsable et correspondant Technique : Dr Daniel Isnardon

    Date de création : 2006

    Site : IPC

    Équipe (CRCM) : 1 ingénieur